Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC103Q8IW40 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms