Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRRT2Q7Z6L0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms