Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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