Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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