Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR4Q13639 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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