Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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