Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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