Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms