Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME1Q06323 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms