Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms