Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms