Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms