Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIM1P81133 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIM1P81133 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIM1P81133 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIM1P81133 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIM1P81133 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIM1P81133 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIM1P81133 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIM1P81133 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIM1P81133 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIM1P81133 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms