Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CAV3P56539 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAV3P56539 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms