Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIRAP54198 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIRAP54198 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIRAP54198 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIRAP54198 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms