Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDH1P40925 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MDH1P40925 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MDH1P40925 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MDH1P40925 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MDH1P40925 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms