Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CASQ1P31415 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CASQ1P31415 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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CASQ1P31415 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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