Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXC13P31276 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms