Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HTR2CP28335 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HTR2CP28335 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2CP28335 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2CP28335 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2CP28335 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2CP28335 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2CP28335 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HTR2CP28335 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2CP28335 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HTR2CP28335 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTR2CP28335 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTR2CP28335 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms