Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms