Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5A1P25705 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms