Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms