Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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