Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GCSHP23434 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GCSHP23434 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GCSHP23434 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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