Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD247P20963 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD247P20963 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD247P20963 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms