Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EGR1P18146 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EGR1P18146 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EGR1P18146 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms