Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms