Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms