Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms