Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP73A6NFT4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms