Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms