Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms