Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms