Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms