Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC11Q9BVV2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms