Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBL7Q96S82 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms