Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms