Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms