Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CTF1Q16619 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CTF1Q16619 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CTF1Q16619 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CTF1Q16619 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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