Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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