Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RASGRF1Q13972 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RASGRF1Q13972 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms