Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RPA4Q13156 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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