Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRDNQ13061 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRDNQ13061 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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