Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STX4Q12846 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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