Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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KCNMA1Q12791 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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