Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms