Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms