Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POU5F1Q01860 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms