Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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TMEM258P61165 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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TMEM258P61165 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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TMEM258P61165 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TMEM258P61165 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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