Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms